技術專欄

WB實驗之内參選擇
供稿:市場部發布時間:2023-06-14浏覽量:205次

免疫印迹(Western Blot)在研究蛋白(bái)相關實驗中(zhōng)是關鍵技術,由于實驗周期較長、步驟繁瑣,影響因素較多,在實驗過程中(zhōng)經常會遇到各種難題。我(wǒ)們需要追根求源,查找并修複問題。今天我(wǒ)們講解下(xià)WB實驗中(zhōng)内參的選擇。

什麽是内參及内參的作用

内參即是内部參照(Internal control),是指在組織和細胞中(zhōng)表達相對穩定的一(yī)類蛋白(bái)質,通常由管家基因編碼。這些蛋白(bái)質被用作檢測蛋白(bái)表達水平變化時的參照物(wù),以确定實驗的準确性和可重複性。

在Western Blot實驗中(zhōng),我(wǒ)們使用内參其實就是使用與内參對應的抗體(tǐ)來檢測内參的表達量。由于内參在不同組織和細胞中(zhōng)的表達量相對穩定,通過檢測每個樣品内參的表達量,我(wǒ)們可以校正上樣誤差,從而獲得更可靠的半定量結果。使用内參還可以作爲空白(bái)對照,檢測蛋白(bái)轉膜情況是否完全,并檢查該實驗中(zhōng)的顯色或發光體(tǐ)系是否正常。通過選擇合适的内參,可以将這些樣本之間的差異消除或最小(xiǎo)化,減少實驗誤差,提高結果的可靠性和可重複性。因此,選擇合适的内參是Western Blot實驗的關鍵步驟之一(yī)。

 

如何選擇合适内參

樣本種屬來源

根據所做的蛋白(bái)樣本的種屬确定,哺乳動物(wù)一(yī)般β-actin、β-tubulin、GAPDH、Lamin B、Na+/K+-ATPase等;植物(wù)樣本一(yī)般選擇Plant actin、Rubisco等;其他來源樣本應參考文獻報道選合适蛋白(bái)作爲内參。

蛋白(bái)表達位置

根據研究對象的不同,選擇不同的内參對于檢測細胞中(zhōng)不同位置的蛋白(bái)非常重要。一(yī)般情況下(xià),選擇β-actin和GAPDH作爲總蛋白(bái)的内參就可以滿足要求。然而,對于細胞質、細胞核、細胞膜等不同位置的蛋白(bái)檢測,我(wǒ)們需要選擇相應的内參,以确保實驗結果具有科學性和可靠性。常用内參抗體(tǐ)分(fēn)子量及其定位情況如下(xià):

a.胞漿和全細胞蛋白(bái):β-actin(43kDa)、GAPDH(37kDa)、Tubulin(55kDa)等;

b.核蛋白(bái):PCNA(29kDa)、Histone H3(17kDa)、Lamin B (66kDa) 等;

c.胞膜蛋白(bái):Na+/K+-ATPase(100kDa)等;

d.線粒體(tǐ)蛋白(bái):COX IV(17kDa)、VDAC1(30kDa)等。

目的蛋白(bái)分(fēn)子量

在選擇内參抗體(tǐ)時應考慮目的蛋白(bái)分(fēn)子量大(dà)小(xiǎo),通常要求目的蛋白(bái)與内參蛋白(bái)分(fēn)子量相差5kDa以上。例如,若檢測的目的蛋白(bái)分(fēn)子量爲45kDa,則不宜選擇分(fēn)子量爲42kDa的β-actin作爲内參,應考慮選擇分(fēn)子量爲36kDa的GAPDH作爲内參。

實驗環境影響

在實際的實驗環境中(zhōng),處理條件可能會影響一(yī)些内參的表達,因此需要考慮研究的信号通路是否會對内參的表達産生(shēng)影響。例如,在糖代謝的研究中(zhōng),不能使用GAPDH作爲内參,因爲GAPDH是參與糖酵解過程中(zhōng)的酶,在某些細胞中(zhōng),缺氧等條件會改變GAPDH的表達;在凋亡實驗時,Lamin等也不适合作爲内參;在加入抗有絲分(fēn)裂和抗真菌藥物(wù)時,Tubulin的表達易受影響,不适合作爲内參等。因此,在設計實驗方案的時候應考慮這些因素并參考相關文獻,在實驗過程中(zhōng),還需要留意内參表達是否出現異常等因素的考慮。

不同的組織特異性

actin 即肌動蛋白(bái),是細胞的一(yī)種重要骨架蛋白(bái)。actin 大(dà)緻可分(fēn)爲六種,其中(zhōng)四種是不同肌肉組織特異性的,包括alpha-skeletal muscle actin、alpha-cardiac muscle actin、alpha-smooth muscle actin和gamma-smooth muscle actin,其餘兩種廣泛分(fēn)布于各種組織中(zhōng),包括beta-actin(β-non-muscle)和gamma-non-muscle actin。這些不同的亞型組織分(fēn)布是不一(yī)樣的,在肌肉組織中(zhōng)beta-actin分(fēn)布就很少,心肌主要是alpha-cardiac muscle actin。因此,不同的組織應選擇不同的内參,不能一(yī)概而論。

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